Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUD1Q5VV17 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD1Q5VV17 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms