Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RPRD2Q5VT52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RPRD2Q5VT52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms