Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO47Q5MNV8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO47Q5MNV8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO47Q5MNV8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO47Q5MNV8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO47Q5MNV8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO47Q5MNV8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms