Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNT1Q5JUK3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms