Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P5Q59GN2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms