Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC153Q494R4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC153Q494R4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms