Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF239Q16600 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF239Q16600 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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