Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VPS72Q15906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VPS72Q15906 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VPS72Q15906 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms