Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
R3HDM1Q15032 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
R3HDM1Q15032 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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