Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3AQ14563 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3AQ14563 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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