Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR1Q13613 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR1Q13613 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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