Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF1Q13351 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF1Q13351 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF1Q13351 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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