Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN3Q13286 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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