Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PRDM2Q13029 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PRDM2Q13029 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
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