Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 APL6YGR261C 2430 nt4.48□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 PHM7YOL084W 2976 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 KIN28YDL108W 921 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 KXD1YGL079W 657 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 HTD2YHR067W 843 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SOL3YHR163W 750 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 SDS3YIL084C 984 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 JLP1YLL057C 1239 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 USB1YLR132C 873 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 CSR1YLR380W 1227 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 BMT2YBR141C 1014 nt4.47□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 MMT1YMR177W 1533 nt4.46□□□□□ -1.69
LCB4Q12246 VHC1YBR235W 3363 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 KTR7YIL085C 1554 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YDR391CYDR391C 699 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YGL088WYGL088W 366 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YGL230CYGL230C 444 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SPO11YHL022C 1197 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 EST3YIL009C-A 546 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 ECM9YKR004C 1134 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GCD7YLR291C 1146 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SEC72YLR292C 582 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GSP1YLR293C 660 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YOR314WYOR314W 330 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 CBP6YBR120C 489 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SMF1YOL122C 1728 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 KAP114YGL241W 3015 nt4.46□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 IMA3YIL172C 1770 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 IMA4YJL221C 1770 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 EUG1YDR518W 1554 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 POL31YJR006W 1464 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YDR133CYDR133C 336 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YFL068WYFL068W 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YFR057WYFR057W 456 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 FRA2YGL220W 363 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 NAT2YGR147C 867 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 LSO1YJR005C-A 282 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RPC25YKL144C 639 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 FMP46YKR049C 402 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YNL181WYNL181W 1224 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YBL096CYBL096C 309 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 CYC2YOR037W 1101 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PLP2YOR281C 861 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GRX5YPL059W 453 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 ARO4YBR249C 1113 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 BOP2YLR267W 1713 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 NGL3YML118W 1518 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PRP43YGL120C 2304 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 TOS3YGL179C 1683 nt4.45□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YJR061WYJR061W 2808 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SWC3YAL011W 1878 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RXT3YDL076C 885 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 HNT2YDR305C 654 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 BOS1YLR078C 735 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 IRC13YOR235W 315 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 GPB1YOR371C 2694 nt4.44□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 BLM10YFL007W 6432 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 SUL2YLR092W 2682 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 MPS3YJL019W 2049 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PDR15YDR406W 4590 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YBR139WYBR139W 1527 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 COQ4YDR204W 1008 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 PCL7YIL050W 858 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YIL163CYIL163C 354 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YMR082CYMR082C 357 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 CUS2YNL286W 858 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 BUD17YNR027W 954 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 ATG34YOL083W 1239 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 MED8YBR193C 672 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 RRP7YCL031C 894 nt4.43□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 MDR1YGR100W 2853 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 YDR056CYDR056C 618 nt4.42□□□□□ -1.7
LCB4Q12246 API2YDR525W 330 nt4.42□□□□□ -1.7
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