Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 CDA2YLR308W 939 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 VPS45YGL095C 1734 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 THI22YPR121W 1719 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 TGL1YKL140W 1647 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 ABP140YOR239W 1887 nt4.45□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MAF1YDR005C 1188 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 DOS2YDR068W 933 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 COS4YFL062W 1140 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 IRC6YFR043C 714 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 COS3YML132W 1140 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 COS2YBR302C 1140 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 OSH3YHR073W 2991 nt4.44□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 TRK1YJL129C 3708 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 FAD1YDL045C 921 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 CIR1YGR207C 786 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 RTA1YGR213C 954 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MIC26YGR235C 702 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MRPL6YHR147C 645 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 KTR2YKR061W 1278 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 SRP40YKR092C 1221 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MED7YOL135C 669 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 KIN2YLR096W 3444 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 ZDS1YMR273C 2748 nt4.43□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 BCK2YER167W 2556 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YDR526CYDR526C 471 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YGL088WYGL088W 366 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 COX4YGL187C 468 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YPT53YNL093W 663 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 POP3YNL282W 588 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 REX4YOL080C 870 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 IRC14YOR135C 342 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MET17YLR303W 1335 nt4.42□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MRPL11YDL202W 750 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 SPC3YLR066W 555 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 CUS2YNL286W 858 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 MTR4YJL050W 3222 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 TMN2YDR107C 2019 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 RNY1YPL123C 1305 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 OPT2YPR194C 2634 nt4.41□□□□□ -1.7
LSP1Q12230 YGL074CYGL074C 327 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 LNP1YHR192W 837 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 EMG1YLR186W 759 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 COQ5YML110C 924 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 MRPL3YMR024W 1173 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 HST1YOL068C 1512 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PRM2YIL037C 1971 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 BDP1YNL039W 1785 nt4.4□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 COS7YDL248W 1152 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SPR28YDR218C 1272 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 COS5YJR161C 1152 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PRR2YDL214C 2100 nt4.39□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 HCA4YJL033W 2313 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDL026WYDL026W 312 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 TMA17YDL110C 453 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 BNA1YJR025C 534 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 IES3YLR052W 753 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 FDH1YOR388C 1131 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 TIF5YPR041W 1218 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 ERG5YMR015C 1617 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 ROD1YOR018W 2514 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 MCM7YBR202W 2538 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 IPI3YNL182C 1668 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 MNT4YNR059W 1743 nt4.38□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 IOC2YLR095C 2439 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 NOG1YPL093W 1944 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PHO92YDR374C 921 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 ADH4YGL256W 1149 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 COX2Q0250 756 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 RPS4BYHR203C 786 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YJR056CYJR056C 711 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 RPS4AYJR145C 786 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 HRT3YLR097C 1035 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 MRM1YOR201C 1239 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PEP4YPL154C 1218 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 RAD7YJR052W 1698 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 CNA1YLR433C 1662 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 GAS5YOL030W 1455 nt4.37□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 KIN4YOR233W 2403 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PPQ1YPL179W 1650 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SLA1YBL007C 3735 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 TRX3YCR083W 384 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR161WYDR161W 1164 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 IRC22YEL001C 678 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YHR022CYHR022C 771 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YLL047WYLL047W 384 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 KRE29YER038C 1395 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SNT1YCR033W 3681 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 FRT2YAL028W 1587 nt4.36□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 PUT2YHR037W 1728 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 TCM62YBR044C 1719 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 snR63snR63 255 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR222WYDR222W 1248 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YIL089WYIL089W 618 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SED5YLR026C 1023 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SPO20YMR017W 1194 nt4.35□□□□□ -1.71
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