Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCBP1Q09161 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCBP1Q09161 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCBP1Q09161 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms