Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 ATP12YJL180C 978 nt4.75□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 RPL22AYLR061W 366 nt4.75□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 OPY1YBR129C 987 nt4.75□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 PPQ1YPL179W 1650 nt4.75□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YCF1YDR135C 4548 nt4.75□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 LRG1YDL240W 3054 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 PRP28YDR243C 1767 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 TDA11YHR159W 1515 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 KTR2YKR061W 1278 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 UPS2YLR168C 693 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 VPS71YML041C 843 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 GPI12YMR281W 915 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 PFA4YOL003C 1137 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 JEN1YKL217W 1851 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 HUL4YJR036C 2679 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 TYW1YPL207W 2433 nt4.74□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 SKM1YOL113W 1968 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 ARO80YDR421W 2853 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 TIF4632YGL049C 2745 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 DIN7YDR263C 1293 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 TFB3YDR460W 966 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YEL074WYEL074W 339 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 IRC6YFR043C 714 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YIL089WYIL089W 618 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 BLS1YLR408C 369 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YLR462WYLR462W 609 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YNR061CYNR061C 660 nt4.73□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 BIK1YCL029C 1323 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 GAS4YOL132W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 ELO2YCR034W 1044 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YMR084WYMR084W 789 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 USA1YML029W 2517 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 YGR266WYGR266W 2106 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 NGL3YML118W 1518 nt4.72□□□□□ -1.65
CTI6Q08923 SEG2YKL105C 3399 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 LEU1YGL009C 2340 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YDL071CYDL071C 375 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YGL193CYGL193C 312 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 CYC1YJR048W 330 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 PIR3YKL163W 978 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 OMA1YKR087C 1038 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YPL025CYPL025C 558 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YPR174CYPR174C 666 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 NPL4YBR170C 1743 nt4.71□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 SKG6YHR149C 2205 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 STB2YMR053C 2553 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 SOF1YLL011W 1470 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 RAD4YER162C 2265 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 PRE9YGR135W 777 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 ISA1YLL027W 753 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 EFM2YBR271W 1260 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 MTH1YDR277C 1302 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 FAS2YPL231W 5664 nt4.7□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 SSU1YPL092W 1377 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 AAD3YCR107W 1092 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 FMP32YFL046W 624 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 MRP13YGR084C 1020 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 TTI2YJR136C 1266 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YLR049CYLR049C 1287 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 ASC1YMR116C 960 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YBR053CYBR053C 1077 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 THI20YOL055C 1656 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 TFA1YKL028W 1449 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YMR1YJR110W 2067 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 GPB1YOR371C 2694 nt4.69□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 IKS1YJL057C 2004 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 ARX1YDR101C 1782 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 ENT1YDL161W 1365 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 MMT1YMR177W 1533 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YPL260WYPL260W 1656 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 CAX4YGR036C 720 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 VMA22YHR060W 546 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 AAD10YJR155W 867 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 RPS19AYOL121C 435 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 PHO84YML123C 1764 nt4.68□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 TYR1YBR166C 1359 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YCR050CYCR050C 309 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 MAG1YER142C 891 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 JLP1YLL057C 1239 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YMR130WYMR130W 909 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 GLO4YOR040W 858 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 OPY2YPR075C 1083 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 TCB3YML072C 4638 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 ALG11YNL048W 1647 nt4.67□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 SSA2YLL024C 1920 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 COX19YLL018C-A 297 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 RPL18BYNL301C 561 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 SET6YPL165C 1122 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 CBP3YPL215W 1008 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YSA1YBR111C 696 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 FRE1YLR214W 2061 nt4.66□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 PIM1YBL022C 3402 nt4.65□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 VPS30YPL120W 1674 nt4.65□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YBR225WYBR225W 2703 nt4.65□□□□□ -1.66
CTI6Q08923 YDR274CYDR274C 372 nt4.65□□□□□ -1.67
CTI6Q08923 DAM1YGR113W 1032 nt4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms