Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1Q07954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1Q07954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms