Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSME1Q06323 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME1Q06323 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms