Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EXOSC9Q06265 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC9Q06265 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms