Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 SNM1YDR478W 597 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 YLR156WYLR156W 345 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 YLR159WYLR159W 345 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 YLR161WYLR161W 345 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 FDH1YOR388C 1131 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 NUP159YIL115C 4383 nt3.55□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 UBP6YFR010W 1500 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 SPT10YJL127C 1923 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 CDC9YDL164C 2268 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 NAM2YLR382C 2685 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 YDR526CYDR526C 471 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 YIL163CYIL163C 354 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 POL12YBL035C 2118 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 ECM8YBR076W 1065 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 DER1YBR201W 636 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 BUD27YFL023W 2391 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 UBX5YDR330W 1503 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 ASI1YMR119W 1875 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 ALR2YFL050C 2577 nt3.54□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 RRN6YBL014C 2685 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 COS4YFL062W 1140 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 COS3YML132W 1140 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 COS2YBR302C 1140 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 SRS2YJL092W 3525 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 TAF1YGR274C 3201 nt3.53□□□□□ -1.84
TRM12Q04235 MSD1YPL104W 1977 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MRH4YGL064C 1686 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 SPI1YER150W 447 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 LNP1YHR192W 837 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 YIR043CYIR043C 693 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RPS1BYML063W 768 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TIF34YMR146C 1044 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 IMP1YMR150C 573 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RIB4YOL143C 510 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MET16YPR167C 786 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RPS9BYBR189W 588 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 ARO9YHR137W 1542 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 JEN1YKL217W 1851 nt3.52□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MAD3YJL013C 1548 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RPS14AYCR031C 414 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 BSC1YDL037C 987 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 DAS2YDR020C 699 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 FOL2YGR267C 732 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 UIP3YAR027W 708 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 PHA2YNL316C 1005 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MED7YOL135C 669 nt3.51□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 DAN4YJR151C 3486 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 VPS45YGL095C 1734 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 STV1YMR054W 2673 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 VPS53YJL029C 2469 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 YDR391CYDR391C 699 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 SPO73YER046W 432 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 COX2Q0250 756 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 IES3YLR052W 753 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 CTR1YPR124W 1221 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 FRM2YCL026C-A 582 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 GPI13YLL031C 3054 nt3.5□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 YGL132WYGL132W 336 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 ECM34YHL043W 513 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 GMH1YKR030W 822 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 IRC25YLR021W 540 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MOH1YBL049W 417 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TED1YIL039W 1422 nt3.49□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TDA1YMR291W 1761 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 GAS5YOL030W 1455 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MNT4YNR059W 1743 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TFA1YKL028W 1449 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 PHO13YDL236W 939 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 ANB1YJR047C 474 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 AIM26YKL037W 357 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RSA3YLR221C 663 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RIM11YMR139W 1113 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 SPA2YLL021W 4401 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 SWI1YPL016W 3945 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TMN2YDR107C 2019 nt3.48□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 LRG1YDL240W 3054 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TMA19YKL056C 504 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 RPS0BYLR048W 759 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 snR37snR37 386 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TAF8YML114C 1533 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 PTR3YFR029W 2037 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 SSM4YIL030C 3960 nt3.47□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 TAF6YGL112C 1551 nt3.46□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 DXO1YDR370C 1329 nt3.46□□□□□ -1.85
TRM12Q04235 MTC3YGL226W 372 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 GRE3YHR104W 984 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 WRS1YOL097C 1299 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 SNT1YCR033W 3681 nt3.46□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 IOC2YLR095C 2439 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 RNA14YMR061W 2034 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 ALA1YOR335C 2877 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 UBC1YDR177W 648 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 SPC42YKL042W 1092 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 YLR036CYLR036C 612 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 YPR022CYPR022C 3402 nt3.45□□□□□ -1.86
TRM12Q04235 RAD54YGL163C 2697 nt3.45□□□□□ -1.86
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