Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC4Q03721 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC4Q03721 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms