Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ERCC6Q03468 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ERCC6Q03468 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ERCC6Q03468 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms