Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 YDR203WYDR203W 318 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 NOP16YER002W 696 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 LSM4YER112W 564 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YGR064WYGR064W 369 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 NAT2YGR147C 867 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YGR226CYGR226C 210 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 VMA22YHR060W 546 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YLR444CYLR444C 303 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RHO2YNL090W 579 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RAS1YOR101W 930 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YPL114WYPL114W 420 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 FRS1YLR060W 1788 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 ALG11YNL048W 1647 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TFC7YOR110W 1308 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YGL176CYGL176C 1665 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 ADE6YGR061C 4077 nt5.18□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YND1YER005W 1893 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 OAF1YAL051W 3144 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 CIK1YMR198W 1785 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 MPO1YGL010W 525 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 EMC4YGL231C 573 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 GVP36YIL041W 981 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 SFC1YJR095W 969 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 BAT2YJR148W 1131 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PRE7YBL041W 726 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 FMP41YNL168C 780 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 CUE5YOR042W 1236 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 MRM1YOR201C 1239 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RPN7YPR108W 1290 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PWR1PWR1 941 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 VPS38YLR360W 1320 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 VTC2YFL004W 2487 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 FRS2YFL022C 1512 nt5.17□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PFK1YGR240C 2964 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 RPL13AYDL082W 600 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 GRX3YDR098C 858 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 ZRT1YGL255W 1131 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 EFG1YGR271C-A 702 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 IKI1YHR187W 930 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YJL028WYJL028W 336 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 ERG3YLR056W 1098 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 DCN1YLR128W 810 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 IMP2YMR035W 534 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 PFA3YNL326C 1011 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YOR364WYOR364W 369 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 MRPL27YBR282W 441 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TEA1YOR337W 2280 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YTA6YPL074W 2265 nt5.16□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 TAF8YML114C 1533 nt5.15□□□□□ -1.58
SRP1Q02821 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 GIR2YDR152W 798 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 RPL24AYGL031C 468 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 MRPL49YJL096W 486 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 CPR7YJR032W 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YNL013CYNL013C 378 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 NRK1YNL129W 723 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YPL199CYPL199C 723 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 SSO1YPL232W 873 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YPR147CYPR147C 915 nt5.15□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 SSK22YCR073C 3996 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 BLM10YFL007W 6432 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 URK1YNR012W 1506 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 CTK1YKL139W 1587 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 MMF1YIL051C 438 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 RFU1YLR073C 603 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 TOM7YNL070W 183 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 snR37snR37 386 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 PMT4YJR143C 2289 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YMR196WYMR196W 3267 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt5.14□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 UBC9YDL064W 474 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YFL051CYFL051C 483 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 RPL27AYHR010W 411 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YIL163CYIL163C 354 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 AIM25YJR100C 984 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 PRS1YKL181W 1284 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 RIB5YBR256C 717 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 BBC1YJL020C 3474 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YGL036WYGL036W 2730 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 LAP3YNL239W 1365 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 GAS4YOL132W 1416 nt5.13□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 BI3Q0115 1554 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 PDH1YPR002W 1551 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 MDM30YLR368W 1797 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YCL065WYCL065W 369 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 TYW3YGL050W 822 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 COG2YGR120C 789 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 ARC15YIL062C 465 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 PRM10YJL108C 1152 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 GCD14YJL125C 1152 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 YJL147CYJL147C 1149 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 MET14YKL001C 609 nt5.12□□□□□ -1.59
SRP1Q02821 TEF4YKL081W 1239 nt5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms