Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DSG1Q02413 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DSG1Q02413 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms