Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
XPCQ01831 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
XPCQ01831 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
XPCQ01831 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
XPCQ01831 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
XPCQ01831 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
XPCQ01831 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XPCQ01831 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
XPCQ01831 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
XPCQ01831 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms