Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MDM2Q00987 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MDM2Q00987 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MDM2Q00987 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms