Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF9Q00978 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms