Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC42EP1Q00587 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms