Protein–RNA interactions for Protein: P97377

Cdk2, Cyclin-dependent kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2P97377 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdk2P97377 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdk2P97377 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdk2P97377 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdk2P97377 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk2P97377 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms