Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ASIC1P78348 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASIC1P78348 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms