Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN2AP68543 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN2AP68543 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms