Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2FP61218 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms