Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVFC1P60507 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVFC1P60507 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms