Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCCD1P59942 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCD1P59942 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms