Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCBP4P57723 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCBP4P57723 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCBP4P57723 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCBP4P57723 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCBP4P57723 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms