Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S2P56377 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S2P56377 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S2P56377 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S2P56377 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S2P56377 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S2P56377 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms