Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAG2P55895 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAG2P55895 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAG2P55895 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAG2P55895 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms