Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF10P55107 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF10P55107 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF10P55107 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GDF10P55107 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF10P55107 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms