Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD23AP54725 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms