Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPC3P51654 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPC3P51654 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPC3P51654 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPC3P51654 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC3P51654 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC3P51654 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC3P51654 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC3P51654 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC3P51654 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms