Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VEGFBP49765 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VEGFBP49765 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms