Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFC4P35249 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFC4P35249 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RFC4P35249 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RFC4P35249 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFC4P35249 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFC4P35249 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFC4P35249 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFC4P35249 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFC4P35249 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFC4P35249 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFC4P35249 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms