Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKBRP32239 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKBRP32239 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms