Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP5DP30049 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP5DP30049 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms