Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPREP23469 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPREP23469 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPREP23469 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPREP23469 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPREP23469 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPREP23469 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPREP23469 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPREP23469 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPREP23469 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPREP23469 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPREP23469 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms