Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP3P21580 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP3P21580 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP3P21580 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFAIP3P21580 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFAIP3P21580 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms