Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A1P19634 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms