Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTLA4P16410 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTLA4P16410 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms